Uix, que error más feo me daba. Ésto lo he arreglado antes de configurar el touchpad pero he preferido postearlo por si le pasa a alguien más.
El error que daba era que el ratón en ocasiones se volvía loco y se iba donde quería apretando todos los botones y liando una que no veas en el escritorio…
Pero en el lenguaje técnico de los logs era éste el problema:

Apr  7 03:38:30 mordor psmouse.c: Wheel Mouse at isa0060/serio2/input0 lost synchronization, throwing 3 bytes away.
Apr  7 03:38:34 mordor Synaptics driver resynced.
Apr  7 03:38:35 mordor Synaptics driver lost sync at byte 4
Apr  7 03:38:35 mordor Synaptics driver lost sync at byte 1
Apr  7 03:38:35 mordor Synaptics driver resynced.
Apr  7 03:38:37 mordor Synaptics driver lost sync at byte 1
Apr  7 03:38:37 mordor Synaptics driver lost sync at byte 1
Apr  7 03:38:37 mordor Synaptics driver lost sync at byte 1
Apr  7 03:38:37 mordor Synaptics driver lost sync at byte 1
Apr  7 03:38:37 mordor Synaptics driver lost sync at byte 1
Apr  7 03:38:37 mordor Synaptics driver resynced.
Apr  7 03:38:39 mordor psmouse.c: Wheel Mouse at isa0060/serio2/input0 lost synchronization, throwing 3 bytes away.

Un error muy feo :)

Se soluciona quitando el soporte APM en el kernel.
Ahora tengo el ACPI y ya no me da el fallo, lo que pasa es que no pilla el estado de la batería y no me apaga automático… pero bueno, ya miraré a ver si puedo hacer algo.